Το Τμήμα ιδρύθηκε το 1990 ως Τμήμα Πληροφορικής, δέχτηκε τους πρώτους φοιτητές του το 1993, ενώ από το 1998 διαθέτει οργανωμένο Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών. Από την ίδρυσή του μέχρι σήμερα, το Τμήμα έχει εξελιχθεί σε ένα από τα κορυφαία Τμήματα της Ελλάδος στην Επιστήμη της Πληροφορικής, μέσα από τις υπερσύγχρονες υποδομές για διδασκαλία και έρευνα που διαθέτει, Πρόγραμμα Σπουδών σχεδιασμένο με βάση τα διεθνή πρότυπα, και τη συνεχή συμμετοχή του σε εθνικά και ευρωπαϊκά προγράμματα έρευνας και ανάπτυξης. Από τον Ιούνιο 2013, το Τμήμα μετεξελίχθηκε σε Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής με 5ετή κύκλο σπουδών (ΦΕΚ A 137/2013).
Οι φοιτητές στο Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής μαθαίνουν να συνδυάζουν τη θεωρία με την πράξη, να αξιοποιούν την αφαιρετική σκέψη, να εφαρμόζουν μεθοδολογίες και τεχνικές από διάφορα επιστημονικά πεδία και να εκτιμούν την αξία του ποιοτικού σχεδιασμού. Επειδή η επιστήμη της πληροφορικής εξελίσσεται ραγδαία, οι φοιτητές μαθαίνουν να προσαρμόζονται στις αλλαγές και στη συνεχή ανάγκη για απόκτηση νέας γνώσης, ενώ εξοικειώνονται με τη δημιουργία νέας γνώσης μέσα από τη συμμετοχή στην έρευνα.
Στα πλαίσια όλων των παραπάνω, το Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής, προσφέρει Προπτυχιακές και Μεταπτυχιακές σπουδές στους φοιτητές του με σκοπό να τους εφοδιάσει με τις γενικές αρχές και να τους βοηθήσει να κατανοήσουν και να αφομοιώσουν στο μέλλον νέες τεχνολογίες, εργαλεία και συστήματα.
Οι προπτυχιακές σπουδές στο Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής διαρκούν 10 εξάμηνα. Τα προσφερόμενα μαθήματα καλύπτουν όλο το φάσμα των απαραίτητων γνώσεων. Τα μαθήματα διακρίνονται σε Υποχρεωτικά και Κατ’ Επιλογήν Υποχρεωτικά. Επιπλέον, στο 10ο εξάμηνο των σπουδών τους, οι φοιτητές εκπονούν διπλωματική εργασία υπό την επίβλεψη ενός μέλους του διδακτικού προσωπικού του Τμήματος.